52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0037 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 355 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  43.55 
 
 		 349 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  30.54 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  25.25 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  27.6 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  25.29 
 
 		 338 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  23.8 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  20.92 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  24.32 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  22.93 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  23.2 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  22.76 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  24.84 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.06 
 
 		 795 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.97 
 
 		 808 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  29.21 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3957  hypothetical protein  29.87 
 
 		 115 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 393 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  30.3 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  34.09 
 
 		 795 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.09 
 
 		 796 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  30.3 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  22.61 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  30.3 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  23.2 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  32.32 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  22.93 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  30.3 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.22 
 
 		 780 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  19.62 
 
 		 878 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.88 
 
 		 778 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  21.91 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.47 
 
 		 682 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  21.97 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.24 
 
 		 679 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  41.54 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>