87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3114 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  707    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  30.13 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  29.62 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  25.75 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  27.03 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  26.23 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  25.75 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  22.19 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  24.17 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 		 800 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  20.67 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.39 
 
 		 808 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 682 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  23.26 
 
 		 427 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 737 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  28.33 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.47 
 
 		 679 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.56 
 
 		 789 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.32 
 
 		 738 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  28.89 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.61 
 
 		 798 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  37.8 
 
 		 872 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.4 
 
 		 773 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  34.21 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.3 
 
 		 773 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  34.21 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 453 aa  46.6  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.77 
 
 		 818 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.31 
 
 		 811 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  28.75 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23 
 
 		 773 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 		 738 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  26.21 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  40.28 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.48 
 
 		 752 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  22.15 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  28.57 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 		 778 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.67 
 
 		 797 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.85 
 
 		 749 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.96 
 
 		 773 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  26.25 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  26.25 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 		 812 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  28.38 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.11 
 
 		 839 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.35 
 
 		 794 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 		 737 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 451 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.28 
 
 		 796 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  32.26 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.09 
 
 		 775 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  24.68 
 
 		 819 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.51 
 
 		 773 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.58 
 
 		 758 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.882312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.93 
 
 		 771 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  26.47 
 
 		 738 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  27.71 
 
 		 502 aa  43.1  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0492  beta-lactamase-like  22.47 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.565585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 		 806 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>