20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1851 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  25.25 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  27.56 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  34.58 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  39.56 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  23.32 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  39.51 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  21.47 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3957  hypothetical protein  31.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  24.24 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.62 
 
 		 795 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  35.62 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.14 
 
 		 796 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  29.6 
 
 		 291 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>