51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3042 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  30.54 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  28.98 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  26.95 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  23.36 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  25.5 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  25.35 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  25.38 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  22.51 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.18 
 
 		 797 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2035  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.77 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.923739  normal  0.0106214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.15 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.6 
 
 		 808 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.95 
 
 		 798 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  24.18 
 
 		 461 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  25.08 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  23.2 
 
 		 286 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  22.52 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  23.53 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  23.53 
 
 		 461 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  23.05 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.43 
 
 		 783 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.71 
 
 		 840 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 		 772 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  24.37 
 
 		 461 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  24.37 
 
 		 461 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  31.91 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  23.18 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  23.73 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.01 
 
 		 746 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  22.7 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.33 
 
 		 883 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.06 
 
 		 796 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>