60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4198 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 365 aa  745    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  29.92 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  28.95 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  26.27 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  28.45 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  29.04 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  26.85 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  26.36 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  22.55 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  25.32 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  25.32 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  25.32 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  24.68 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  24.09 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 294 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  25.09 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 		 778 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  22.48 
 
 		 795 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0217  hypothetical protein  22.16 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  23.59 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.03 
 
 		 749 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  24.26 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  30.47 
 
 		 888 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.18 
 
 		 797 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.96 
 
 		 837 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  22.52 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 		 773 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  21.78 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.61 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  30.11 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3957  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  25.9 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  30.61 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  25.98 
 
 		 773 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  40.38 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  32.91 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.94 
 
 		 780 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 		 654 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  25.18 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.88 
 
 		 773 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.91 
 
 		 814 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.11 
 
 		 679 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 		 773 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.98 
 
 		 773 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  23.41 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.71 
 
 		 726 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.71 
 
 		 726 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  27.54 
 
 		 238 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 283 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>