41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3308 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 393 aa  819    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  25.33 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  23.43 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  22.96 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  22.19 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  31.25 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.96 
 
 		 773 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  33.03 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.96 
 
 		 773 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.23 
 
 		 770 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  31.82 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 		 859 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.18 
 
 		 752 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  27.43 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  26.21 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.14 
 
 		 679 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  29.13 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.85 
 
 		 802 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  28.57 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  28.57 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  28.57 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.57 
 
 		 789 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.09 
 
 		 759 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 281 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.58 
 
 		 773 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.58 
 
 		 773 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.55 
 
 		 778 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  25.88 
 
 		 284 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  28.57 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.04 
 
 		 749 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  30.34 
 
 		 747 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.71 
 
 		 682 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  29.55 
 
 		 502 aa  43.1  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  42.7  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>