23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1793 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  46.19 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  24.25 
 
 		 349 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  21.2 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  20.92 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  34.58 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  23.82 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  24.38 
 
 		 289 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  23.28 
 
 		 348 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  23.26 
 
 		 345 aa  49.7  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.93 
 
 		 790 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5058  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.69 
 
 		 837 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.05 
 
 		 772 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  20 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  25 
 
 		 331 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2200  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.11 
 
 		 873 aa  43.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2739  hypothetical protein  23.53 
 
 		 371 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.5 
 
 		 806 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>