28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2712 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  36.83 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  32.64 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  27.17 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  26.36 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  26.82 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5652  hypothetical protein  23.92 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  34.07 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  21.2 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.05 
 
 		 679 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  18.48 
 
 		 883 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 		 682 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3957  hypothetical protein  31.76 
 
 		 115 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321543  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 283 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.11 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.11 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0732  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16061  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0828  metallo-beta-lactamase superfamily protein, putative  27.93 
 
 		 688 aa  43.1  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0864  beta-lactamase-like  28.05 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  38.24 
 
 		 795 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.24 
 
 		 795 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>