21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0839 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0839  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  814    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 
365 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4563  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.079471  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1822  hypothetical protein  25.21 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0037  Zn-dependent hydrolase  23.8 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000581778  hitchhiker  0.000547096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3308  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.154188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2712  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.6358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3114  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4020  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
305 aa  63.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1793  hypothetical protein  23.82 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.934351  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3042  hypothetical protein  23.36 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0062  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  31.65 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1851  hypothetical protein  21.47 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  34 
 
 
348 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  32.35 
 
 
821 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  35.37 
 
 
300 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.25 
 
 
331 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>