35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1616 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  45 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  29.29 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  29.29 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 284 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 		 300 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 		 300 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.18 
 
 		 883 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  36 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  37.04 
 
 		 331 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  42.86 
 
 		 829 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  36.23 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  36.23 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  34.18 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4198  beta-lactamase domain protein  33.73 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.49 
 
 		 795 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.94 
 
 		 734 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.5 
 
 		 770 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.67 
 
 		 796 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  38.24 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  40.68 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  41.82 
 
 		 295 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40 
 
 		 781 aa  43.1  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>