222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0492 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0492  beta-lactamase-like  100 
 
 
338 aa  692    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.565585  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0623  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 
417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.24 
 
 
797 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.06 
 
 
798 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  30.3 
 
 
461 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  30.3 
 
 
461 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
451 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.55 
 
 
461 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.17 
 
 
461 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  28.79 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.5 
 
 
808 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  28.85 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  25.19 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  26.88 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  25.8 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  26.48 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  26.48 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  26.48 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  26.48 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  26.48 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  26.48 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.37 
 
 
794 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  25.77 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27 
 
 
771 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  25.3 
 
 
502 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3008  hypothetical protein  24.92 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.56 
 
 
814 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.52 
 
 
811 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.37 
 
 
789 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  23.85 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  25.59 
 
 
738 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.64 
 
 
868 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.18 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.62 
 
 
770 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  26.74 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.26 
 
 
840 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.38 
 
 
797 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.55 
 
 
831 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  24.42 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.3 
 
 
726 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.3 
 
 
726 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.73 
 
 
777 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.82 
 
 
845 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0342  hypothetical protein  24.92 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120057  hitchhiker  0.001602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 
421 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.69 
 
 
746 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  27.84 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  25.98 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  25.98 
 
 
808 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
451 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
802 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.84 
 
 
783 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.74 
 
 
846 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  28.34 
 
 
979 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.54 
 
 
682 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  24.74 
 
 
795 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.45 
 
 
734 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
856 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
842 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.63 
 
 
795 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.49 
 
 
948 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
856 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
856 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
856 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
856 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.55 
 
 
842 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.45 
 
 
839 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.84 
 
 
775 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.31 
 
 
835 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 
453 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.83 
 
 
818 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  23.85 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 
778 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.7 
 
 
837 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.36 
 
 
773 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  25.66 
 
 
846 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.17 
 
 
752 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  25.51 
 
 
872 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl369  DNA uptake protein  33.06 
 
 
607 aa  57  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.399e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.2 
 
 
791 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
845 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.57 
 
 
851 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>