89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0623 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0623  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 417 aa  863    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0492  beta-lactamase-like  37.75 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.565585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 761 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  25.91 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  22.76 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  22.76 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.91 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0342  hypothetical protein  25.57 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120057  hitchhiker  0.001602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.11 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  22.86 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  22.86 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6746  hypothetical protein  20.9 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  21.79 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  24.49 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.48 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  24.08 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  22.45 
 
 		 300 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 		 846 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  24.08 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.15 
 
 		 798 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  22.04 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  25.45 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 		 794 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  23.6 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  24.9 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.1 
 
 		 737 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.8 
 
 		 783 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 281 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  22.5 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 750 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  21.75 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  23.67 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  25.4 
 
 		 502 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  25.2 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  24.29 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  22.44 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0031  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.45 
 
 		 797 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3008  hypothetical protein  23.18 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 283 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  21.63 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3769  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 498 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.7 
 
 		 778 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.02 
 
 		 851 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.47 
 
 		 809 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.17 
 
 		 811 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.35 
 
 		 896 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.07 
 
 		 780 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.63 
 
 		 868 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  27.57 
 
 		 872 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  25 
 
 		 846 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.82 
 
 		 839 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  30.47 
 
 		 829 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  32.56 
 
 		 257 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.48 
 
 		 791 aa  46.6  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 		 738 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.84 
 
 		 773 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 		 738 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 		 737 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.37 
 
 		 840 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.65 
 
 		 757 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  30.25 
 
 		 826 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.51 
 
 		 840 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.22 
 
 		 840 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.59 
 
 		 948 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.25 
 
 		 860 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  22.46 
 
 		 768 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.07 
 
 		 860 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  25.1 
 
 		 747 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  26.03 
 
 		 847 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  22.4 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.54 
 
 		 773 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0764  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.61 
 
 		 811 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.804759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.31 
 
 		 773 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>