216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1181 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1181  putative oxidoreductase  100 
 
 
307 aa  634    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.169664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 
309 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  25.51 
 
 
306 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  27.34 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  26.87 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2205  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 
314 aa  92.4  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  24.15 
 
 
301 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
332 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  26.12 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
311 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 
317 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.43 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  23.72 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  21.99 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  22.55 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  21.54 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  21.61 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  22.26 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  22.82 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  24.22 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  25.23 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  24.25 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  21.91 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  21.99 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  25.6 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  24.62 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  23.51 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  21.45 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  26.05 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  24.54 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  24.7 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  23.86 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  21.48 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  22.79 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  24.07 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  24.77 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  27.14 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.72 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  23.63 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  21.67 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  22.4 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  23 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  23.96 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  22.19 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  23.91 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  22.95 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  23.91 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  23.55 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  21.59 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  23.57 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  23.18 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  22.22 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.23 
 
 
315 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  23.21 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  23.37 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  23.23 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  24.46 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  23.02 
 
 
332 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  25.38 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 
316 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>