281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2205 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2205  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
314 aa  645    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 
311 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 
318 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
307 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.86 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.4 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.44 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 
300 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 
309 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
301 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 
314 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
313 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 
301 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1181  putative oxidoreductase  27.66 
 
 
307 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.169664  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 
301 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 
345 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.15 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 
317 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.07 
 
 
307 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  25.7 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
306 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.72 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  23.49 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  23.78 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  24.11 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  23.13 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  23.76 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.07 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.92 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.09 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  22.42 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.36 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.07 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  26.24 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  24.52 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  29.95 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  26.38 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 
447 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.12 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  25.64 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  23.47 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  24.3 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  26.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  24.67 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  23.96 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.61 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  23 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  22.68 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  24.26 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  24.44 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.22 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  25.2 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  24.58 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  22.7 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.61 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>