166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0369 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0369  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 		 189 aa  394  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.424148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3682  UDP-sugar diphosphatase  52.54 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3661  UDP-sugar diphosphatase  52.54 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1588  UDP-sugar diphosphatase  55.36 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0698  NUDIX domain-containing protein  38.25 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0079062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0730  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  35.71 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.474724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1625  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  37.43 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1333  NUDIX family hydrolase  37.99 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.296526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0497  NUDIX domain-containing protein  35.16 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0472  NUDIX domain-containing protein  35.16 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1033  NUDIX domain protein  35 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380959  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1492  NUDIX domain-containing protein  34.62 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  35.48 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  35.48 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  35.48 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  35.48 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  34.84 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  31.61 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  35.64 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  30.97 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  30.97 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  30.97 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  30.97 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  30.97 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  35.77 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  35.77 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  35.77 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  35.77 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  29.8 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  29.01 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  31.76 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  28.3 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  28.3 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.19 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  25.87 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  27.1 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  30.14 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  25.75 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  30 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.33 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.77 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.97 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.77 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  25.48 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  25.3 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.08 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.08 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.13 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  27.16 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  26.06 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  30.33 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.13 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  25.96 
 
 		 361 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  26.8 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  23.45 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  24.67 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  25 
 
 		 361 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  23.45 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>