143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1033 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1033  NUDIX domain protein  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380959  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0472  NUDIX domain-containing protein  59.68 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0497  NUDIX domain-containing protein  59.68 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1492  NUDIX domain-containing protein  59.14 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0698  NUDIX domain-containing protein  45.16 
 
 		 194 aa  158  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0079062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0730  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  44.44 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.474724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1333  NUDIX family hydrolase  45.03 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.296526  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1625  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  37.63 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3661  UDP-sugar diphosphatase  38.83 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3682  UDP-sugar diphosphatase  38.3 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1588  UDP-sugar diphosphatase  43.24 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0369  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.424148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  32.77 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  32.77 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  31.93 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  31.93 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  31.93 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  31.93 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  33.61 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  34.43 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  34.43 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  34.43 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  34.43 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  31.93 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  28.93 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  31.93 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  31.93 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  31.09 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  29.75 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  23.13 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  24.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  24.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  24.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  24.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  24.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  24.64 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  26.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  23.61 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  27.4 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  24.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  25.5 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  27.4 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  24.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  24.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  25 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  25 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  24.52 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  26.06 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  24.69 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  24.69 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  24.69 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  24.69 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  27.42 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  26.67 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0696  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  23.13 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  22.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  25 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  26.17 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  26.17 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  21.83 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  21.83 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  22.78 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  21.83 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  21.83 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>