More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4150 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4150  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0659  fimbrial Z protein; signal transducer  41.67 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.379451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  51.02 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  51.02 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  51.02 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  51.02 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  51.02 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.82 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.82 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.82 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  41.67 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3572  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  29.03 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1791  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  25.58 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  41.67 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.23 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 454 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  37.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>