128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3019 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  327  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  69.18 
 
 
160 aa  217  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  67.92 
 
 
160 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  58.49 
 
 
160 aa  204  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  57.86 
 
 
160 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  52.76 
 
 
163 aa  183  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  52.15 
 
 
163 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  51.53 
 
 
163 aa  180  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  54.72 
 
 
160 aa  180  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  40.25 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  40.51 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  36.88 
 
 
160 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  36.25 
 
 
160 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  36.25 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  36.88 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  37.97 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  41.51 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.15 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  36.97 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  36.97 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  38.27 
 
 
161 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  38.27 
 
 
161 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  36.97 
 
 
161 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  38.27 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  38.27 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.49 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.94 
 
 
165 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.37 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  41.88 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  36.08 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  46.54 
 
 
162 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  46.54 
 
 
162 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  41.36 
 
 
162 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  38.61 
 
 
161 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  38.61 
 
 
161 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.61 
 
 
189 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  40 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  36.54 
 
 
164 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  36.25 
 
 
161 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  31.21 
 
 
176 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  33.53 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  37.5 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  37.5 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  38.65 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.65 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  38.27 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  36.31 
 
 
158 aa  94  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  32.1 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  35.88 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.99 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  36.77 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  34.39 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.18 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  30.18 
 
 
180 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  30.18 
 
 
172 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.18 
 
 
172 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  31.76 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  31.76 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  31.76 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  33.96 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  33.56 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  25.31 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  25.93 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.61 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.07 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.69 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  32.38 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  26.54 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  28.57 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  31.19 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  30.17 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  29.03 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  28.48 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  25.93 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  23.31 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0655  fimbrial protein-related protein  28.57 
 
 
108 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  23.38 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  22.29 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  22.78 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  24.14 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>