135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1481 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  100 
 
 		 189 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  339  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  339  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  57.59 
 
 		 160 aa  215  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  56.96 
 
 		 160 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  56.33 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  56.33 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  56.33 
 
 		 160 aa  207  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  56.96 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.86 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  56.33 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  56.33 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  56.33 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  56.96 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  56.33 
 
 		 161 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  55.7 
 
 		 161 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  55.7 
 
 		 161 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  55.7 
 
 		 161 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  56.96 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  57.59 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  56.52 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  57.59 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  57.59 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  57.59 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  57.59 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  57.59 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  57.14 
 
 		 161 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  55.28 
 
 		 161 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  54.66 
 
 		 161 aa  177  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  56.33 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  51.27 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  53.85 
 
 		 157 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  51.27 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  50.63 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  42.14 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  41.77 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  42.24 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.74 
 
 		 165 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  40.51 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.74 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  36.08 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  41.1 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  40.49 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.08 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  44.07 
 
 		 129 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  38.61 
 
 		 160 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  37.35 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  38.12 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  38.03 
 
 		 166 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  33.55 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  36.9 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  36.31 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.31 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.31 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  32.93 
 
 		 172 aa  91.3  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  32.93 
 
 		 172 aa  91.3  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  34.36 
 
 		 160 aa  90.9  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  32.93 
 
 		 172 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  34.97 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  26.75 
 
 		 160 aa  87.8  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  34.44 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.68 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  33.77 
 
 		 163 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.62 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  36.91 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.1 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.1 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  27.63 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  27.63 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  30.57 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  32.62 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  30.57 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  27.92 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  30.72 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.82 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000845431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  25.79 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  25.16 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  25.64 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>