112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00264 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  345  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  52 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  40.96 
 
 
160 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  45.12 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  44.51 
 
 
162 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  44.51 
 
 
162 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.28 
 
 
160 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  32.32 
 
 
160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  32.32 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  32.32 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  41.5 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  32.32 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  33.11 
 
 
160 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.78 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  35.81 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.93 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  27.03 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  27.03 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  27.03 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  34.71 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  27.03 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  27.03 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  27.03 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  26.35 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  34.01 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  33.56 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.21 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  34.9 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  28.4 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  31.54 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  29.93 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  30.43 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  32.03 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  32.03 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.03 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.54 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  26.95 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  27.06 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  28.48 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.98 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  28.14 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  30.54 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  29.68 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.27 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.33 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.71 
 
 
172 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  26.97 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.81 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  26.71 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  26.71 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  26 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  26 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  28.26 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  28.26 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  28.26 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  28.26 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  28.26 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  26.57 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  31.76 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  31.76 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  26.09 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  27.14 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  27.14 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.99 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000845431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  27.63 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.9 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  23.24 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  26.62 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.17 
 
 
162 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.59 
 
 
162 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  26.85 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  28.48 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  26.32 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  25.32 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  27.01 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  29.05 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000028  hemolysin-coregulated protein  25 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2361  hypothetical protein  27.07 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  30.2 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  31.11 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  34.31 
 
 
129 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>