133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4089 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  67.08 
 
 		 160 aa  198  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  56.05 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  62.89 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  48.73 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  64.78 
 
 		 162 aa  156  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  64.78 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  45.34 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  45.34 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  44.94 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  45.34 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  44.94 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  45.57 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  45.96 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  44.94 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  46.84 
 
 		 160 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  45.96 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  45.96 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  44.72 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  47.8 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  46.84 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  49.06 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  47.47 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  45.91 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  51.33 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  41.77 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  45.91 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  54.36 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  46.54 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  39.24 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  43.67 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.58 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  36.81 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  43.95 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  41.14 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  41.14 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  41.14 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.27 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  42.21 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  43.31 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  36.25 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  36.88 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  36.25 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  38.3 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  38.99 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  36.08 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  38.61 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  39.02 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  37.11 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  32.52 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  32.52 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  33.95 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  34.16 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.87 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.28 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.36 
 
 		 174 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000845431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  36.69 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  36.69 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  32.92 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.55 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.27 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.4 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.73 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  40.24 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  35.67 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  30.59 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  30.59 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  30.59 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.4 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  30.59 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  32.74 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  29.94 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  34.29 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  32.69 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  32.28 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  29.94 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>