122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5980 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  329  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  54.49 
 
 		 160 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  44.1 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  44.72 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  44.72 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  40.99 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  41.4 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  41.29 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  41.29 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  41.29 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  41.29 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.92 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.3 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.48 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  27.1 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  28.21 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  28.21 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  28.21 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  28.49 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  27.56 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  27.56 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  27.56 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.22 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  27.22 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4764  putative cytoplasmic protein  27.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  27.04 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  23.72 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4839  putative cytoplasmic protein  27.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4913  hypothetical protein  27.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4863  putative cytoplasmic protein  27.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.676773  normal  0.639801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  25.66 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  27.04 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  26.75 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  26.32 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  28.07 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  22.15 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  27.43 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.2 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.2 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  26.27 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  26.11 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  26.27 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.68 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.27 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  30.67 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  22.78 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4911  hypothetical protein  26.87 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.125309  normal  0.115148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.22 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  24.55 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.54 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  23.42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  21.52 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  21.52 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.49 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  21.52 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  27.43 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2077  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.15 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00363318  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  24.05 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.53 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  25.49 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  25.95 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  24.53 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.15 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  24.84 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  20.89 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  23.27 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  25.22 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  25.22 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  23.27 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  23.27 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  25.22 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  23.89 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  27.21 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  27.35 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  22.37 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  24.38 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  23.23 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  25.45 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  22.15 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  24.79 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>