135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5238 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  332  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  86.42 
 
 		 162 aa  295  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  92.59 
 
 		 181 aa  283  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  79.01 
 
 		 162 aa  230  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  76.54 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  76.54 
 
 		 162 aa  223  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  67.28 
 
 		 162 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  57.83 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  50.57 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  44.51 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  50 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  49.42 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  49.42 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  49.42 
 
 		 172 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0655  fimbrial protein-related protein  79.76 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.34 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.34 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  51.74 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  31.29 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  31.29 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  31.29 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  31.29 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  31.29 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  30.06 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  30.67 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  32.72 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  32.5 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  32.5 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  32.5 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  31.87 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  33.12 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  34.16 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.52 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  31.9 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  31.21 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.75 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  35.11 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  35.11 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  35.11 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  35.11 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  29.01 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.35 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.35 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.35 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  33.1 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  24.69 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  29.94 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  29.3 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  30.86 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  25.61 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.45 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.83 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  30.57 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  30.57 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.57 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  29.87 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  26.83 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  26.22 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.63 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  28.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.22 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  27.91 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  30.14 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  29.87 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  27.56 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  30.14 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  25.31 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  24.85 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  24.85 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  25.31 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  26.57 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  27.78 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  21.6 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  26.25 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>