86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0655 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0655  fimbrial protein-related protein  100 
 
 		 108 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  76.19 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  74.74 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  78.82 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  75.29 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  72.94 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  71.76 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  51.19 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  51.76 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  65.48 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  43.53 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  53.57 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  52.94 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  51.76 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  51.76 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  51.76 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.88 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.88 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  35.8 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  34.57 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  34.57 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  34.57 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  33.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  33.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  32.1 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4345  hypothetical protein  66.67 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  34.12 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  35.14 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  33.73 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  36.76 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  31.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  31.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  31.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  31.33 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.35 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  31.33 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  35.82 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.6 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  36.76 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.84 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.84 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  26.19 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.71 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  29.41 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  26.51 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  32.84 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  28.92 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  30.86 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.1 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  30.99 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  28.92 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  27.71 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  40.54 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  22.54 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  31.33 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>