133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1607 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  332  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  99.38 
 
 
160 aa  330  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  99.38 
 
 
160 aa  329  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  97.5 
 
 
160 aa  324  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  87.5 
 
 
160 aa  290  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  87.5 
 
 
160 aa  277  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  69.62 
 
 
160 aa  239  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  74.68 
 
 
161 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  71.52 
 
 
160 aa  221  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  68.35 
 
 
161 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 
161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 
161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 
161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 
161 aa  213  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 
161 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 
161 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  62.66 
 
 
161 aa  212  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  66.46 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  68.99 
 
 
161 aa  210  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  68.35 
 
 
161 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  67.72 
 
 
161 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  56.33 
 
 
189 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  56.33 
 
 
161 aa  191  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  56.33 
 
 
161 aa  191  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  60 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  58.75 
 
 
158 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  55.13 
 
 
155 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  58.13 
 
 
157 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  55.35 
 
 
160 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.88 
 
 
160 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  55.46 
 
 
129 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  46.2 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  44.94 
 
 
161 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  35.62 
 
 
163 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  38.75 
 
 
160 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  42.5 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  46.25 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.51 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  44.38 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  43.75 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  35.03 
 
 
164 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  40.26 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  36.88 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  36.25 
 
 
160 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  38.27 
 
 
160 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  36.25 
 
 
160 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  35.76 
 
 
172 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  35.76 
 
 
172 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  35.98 
 
 
172 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  38.73 
 
 
166 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.8 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.75 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.57 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  90.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  28.48 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  30.92 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  33.79 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  33.79 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  32.74 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.74 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.74 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  29.41 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.39 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  31.1 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.79 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  31.87 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  28.85 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  30.63 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.69 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  28.76 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  28.76 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  28.76 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  30.63 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  30.92 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  30.26 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  30.26 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>