136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1681 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  100 
 
 		 161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  80.75 
 
 		 160 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  75.32 
 
 		 160 aa  261  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  74.68 
 
 		 160 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  74.68 
 
 		 160 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  75.32 
 
 		 160 aa  259  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  78.88 
 
 		 161 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  74.68 
 
 		 160 aa  250  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  79.5 
 
 		 160 aa  247  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  76.4 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  76.4 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  76.4 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  76.4 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  76.4 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  76.4 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  75.78 
 
 		 161 aa  243  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  77.64 
 
 		 161 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  78.26 
 
 		 161 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  69.38 
 
 		 161 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  69.38 
 
 		 161 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  74.68 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  70 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  69.38 
 
 		 161 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  77.64 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  70 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  70 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  70 
 
 		 161 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  58.86 
 
 		 189 aa  194  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  58.86 
 
 		 161 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  58.86 
 
 		 161 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  59.75 
 
 		 155 aa  193  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  65.19 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  67.09 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  61.94 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  55.7 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  50.62 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  60.17 
 
 		 129 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  44.94 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  47.8 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  40.99 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  41.25 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  45.62 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  47.24 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  46.63 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  44.72 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  40.37 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  34.76 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  41.61 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  40.67 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  39.75 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.24 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  34.57 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  39.13 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.41 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  33.12 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  38.73 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  36.59 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  36.42 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.74 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  33.13 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  30.19 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  32.53 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  32.7 
 
 		 163 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  33.8 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  34.91 
 
 		 180 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  32.7 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  34.91 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.88 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.32 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.1 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  31.9 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  27.39 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.39 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  27.45 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  27.45 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  27.45 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  27.45 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.33 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000845431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  28.1 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.8 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>