102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  100 
 
 		 330 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.49 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  43.56 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.63 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  32.89 
 
 		 310 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  31.84 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  31.16 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  33.74 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.04 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  33.93 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  31.75 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  37.31 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  34.68 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  34.41 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  33.79 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  37.2 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  32.33 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  30.45 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  31.63 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  31.95 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  31.54 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  23.97 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  31.56 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  30.9 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.36 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  30.23 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  28.45 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  31.98 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  33.62 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  25.12 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.18 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  29.66 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  26.34 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  29.82 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  26.11 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  29.49 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  30.47 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  30.95 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  37.04 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  29.61 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  30.13 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.62 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  33.5 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  23.69 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  29.18 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  33.74 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  27.83 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  28.89 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  26.98 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.85 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  22.94 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  31.32 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  29.05 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  24.6 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  29.13 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  24.6 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  24.6 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  24.6 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  24.6 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  24.6 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  33.16 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  24.24 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  30.38 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  24.24 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  24.24 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  24.24 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  24.24 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  27.85 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  22.88 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  30.41 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  31.98 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.39 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  28.26 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  30.7 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.91 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>