156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  98 
 
 		 300 aa  544  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  46.62 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.34 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  45.45 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  40.51 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  40.91 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  37.73 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.46 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  34.23 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 		 368 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  34.5 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  32.73 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  34.11 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  34.11 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  36.99 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  37.39 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.79 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  29.14 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  28.98 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  34.84 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  33.95 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  31.77 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  33.8 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.71 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  32.05 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.21 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  30.66 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  31.77 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  33.56 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.63 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  26.48 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  30.66 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  32.28 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  31.9 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.4 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  30.61 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  31.14 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.24 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.08 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  27.56 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.7 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  30.11 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.08 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  30.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  33.81 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  28.62 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  35.11 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  23.71 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.32 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  32.96 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  29.52 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  30.07 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  29.02 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  28.37 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  31.11 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  25.36 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  30.65 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.7 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.71 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  29.33 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  28.67 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.48 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  25.69 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 287 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>