More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1398 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 368 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  60 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.5 
 
 		 313 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  41 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  42.58 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  35.25 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.97 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  39.09 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  36.12 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  39.63 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  39.63 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  39.63 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  41.86 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  44.21 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  39.39 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.88 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  38.21 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  37.46 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.39 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.08 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  35.02 
 
 		 295 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.35 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  42.64 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  41.86 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.69 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  37.54 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  26.01 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  37.68 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  36.14 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  37.96 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  33.55 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  34.02 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  34.74 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  35.34 
 
 		 297 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 		 290 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  31.75 
 
 		 285 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.77 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.51 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  36.13 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  37 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.18 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  34.4 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  35.42 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  35.14 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  31.21 
 
 		 312 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  37.02 
 
 		 289 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  32.98 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.72 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.96 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  31.5 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  35.14 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  34.43 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  32.53 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  35.93 
 
 		 304 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  33.76 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  30.43 
 
 		 299 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  35.42 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 296 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  25.61 
 
 		 307 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  28.05 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.68 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  35.93 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  35.36 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  37.02 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  31.03 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  29.28 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  30.74 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.29 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  31.87 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  30.48 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  26.37 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.15 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.37 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  29.63 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  31.69 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.28 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  30.17 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  32.47 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.84 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  28.87 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  30.26 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  30.03 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>