More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20250  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  100 
 
 		 650 aa  1359    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.174498  normal  0.244948 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3269  N-6 DNA methylase  33.6 
 
 		 630 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0430  restriction enzyme, alpha subunit  28.31 
 
 		 656 aa  128  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.727595  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 710 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0537  N-6 DNA methylase  25.05 
 
 		 669 aa  91.3  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  30.36 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  24.48 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 513 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  24.61 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.97 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  24.27 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  26.03 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.67 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  26.18 
 
 		 508 aa  80.1  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  24.54 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.46 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  27.48 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.51 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  24.34 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.6 
 
 		 703 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  24.73 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  26.39 
 
 		 834 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.73 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  26.14 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  22.74 
 
 		 495 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  24.24 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  27.43 
 
 		 492 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  24.82 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  24.3 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  23.38 
 
 		 814 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  23.68 
 
 		 500 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  23.79 
 
 		 526 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  24.78 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  23.72 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  24.36 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  25.33 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  25.21 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  23.11 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  22.26 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 810 aa  70.5  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  24.39 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  23.83 
 
 		 493 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  20.82 
 
 		 501 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  24.59 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  24.58 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  20.81 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  23.3 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  22.36 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  21.9 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  22.4 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 		 768 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  25.2 
 
 		 775 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  23.38 
 
 		 873 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  25 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  25.65 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  21.96 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  22.75 
 
 		 891 aa  67.8  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  22.01 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  22.46 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  24.61 
 
 		 623 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  21.32 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  23.99 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  21.38 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  20.91 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  29.07 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  23.41 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  22.61 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  29.07 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  21.83 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  22.74 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  22.98 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  22.86 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.87 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  28.63 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  28.63 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  23.31 
 
 		 526 aa  63.9  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  22.84 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  22.84 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  23.6 
 
 		 501 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 		 911 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.05 
 
 		 548 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  24.35 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  22.38 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>