More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0430 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0430  restriction enzyme, alpha subunit  100 
 
 		 656 aa  1342    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.727595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3269  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 630 aa  312  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0537  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 669 aa  209  9e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  26.81 
 
 		 710 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20250  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.31 
 
 		 650 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.174498  normal  0.244948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  30.56 
 
 		 545 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  30.59 
 
 		 527 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  28.96 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  30.28 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 816 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.82 
 
 		 499 aa  97.8  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  28.51 
 
 		 506 aa  97.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  27.41 
 
 		 808 aa  96.3  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  28.03 
 
 		 489 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 		 508 aa  94.7  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  28.06 
 
 		 490 aa  94.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 		 493 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  27.8 
 
 		 494 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.72 
 
 		 814 aa  92.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 505 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.88 
 
 		 504 aa  91.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 		 484 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  26.01 
 
 		 873 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.55 
 
 		 815 aa  91.3  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 513 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  25.09 
 
 		 1005 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  25.26 
 
 		 544 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 549 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  26.46 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.54 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.83 
 
 		 708 aa  89  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.76 
 
 		 860 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  26.07 
 
 		 493 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.57 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 496 aa  88.2  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  24.11 
 
 		 504 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  25.34 
 
 		 891 aa  87.4  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.03 
 
 		 513 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.07 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  24.78 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  28.08 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23.93 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  24.04 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  25.39 
 
 		 480 aa  83.2  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  31.47 
 
 		 484 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.69 
 
 		 504 aa  83.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  26.4 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  27.76 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  25.48 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  26.81 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  26.74 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.15 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  22.14 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  25.2 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  25.2 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  25.83 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  26.52 
 
 		 810 aa  81.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  24.92 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  28.92 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  23.8 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  24.85 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  24.7 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.94 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  24.7 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  24.23 
 
 		 579 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  26.52 
 
 		 524 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  24.41 
 
 		 494 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.28 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 834 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  27.43 
 
 		 1362 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20.06 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  23.92 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  26.22 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  26.87 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.17 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  26.82 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  26.47 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  26.09 
 
 		 570 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 		 501 aa  77  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 847 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  24.2 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.64 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  25.3 
 
 		 908 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25.39 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>