More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0537 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0537  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 669 aa  1367    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0430  restriction enzyme, alpha subunit  29.6 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.727595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3269  N-6 DNA methylase  29.66 
 
 		 630 aa  206  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000126055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  30.82 
 
 		 710 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20250  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.05 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.174498  normal  0.244948 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  28.89 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 		 846 aa  89  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  27.92 
 
 		 517 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.91 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  28.42 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 834 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27.59 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.87 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  25.29 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  26.32 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.1 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  26.92 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  25.48 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  25.8 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  25.54 
 
 		 494 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 544 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 570 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  24.03 
 
 		 549 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  26.71 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.82 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  25.1 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  25.31 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  23.65 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.58 
 
 		 654 aa  74.3  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  23.26 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  22.96 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  26.06 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 775 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.3 
 
 		 501 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  24.85 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  24.93 
 
 		 873 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  23.65 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.31 
 
 		 489 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  23.39 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  24.03 
 
 		 815 aa  72  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  21.8 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  24.76 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  23.58 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  24.45 
 
 		 1005 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  25.36 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  23.67 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  24.2 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  25.6 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.33 
 
 		 479 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  25.24 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 		 567 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  23.66 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  25.1 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  21.22 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  24.4 
 
 		 570 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  24.27 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  24.48 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  24.41 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  25.91 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  24.85 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 484 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.86 
 
 		 822 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  23.01 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  24 
 
 		 514 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2085  N-6 DNA methylase  21.38 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000172006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  25.09 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  20.6 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  24.17 
 
 		 659 aa  65.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  23.86 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  23.43 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  20.18 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.26 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  21.66 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  21.87 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  24.08 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  24.02 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  24.7 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>