63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3051 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  92.96 
 
 		 341 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  93.26 
 
 		 341 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  94.13 
 
 		 342 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  90.62 
 
 		 342 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  100 
 
 		 343 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  86.18 
 
 		 343 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  64.79 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  63.64 
 
 		 339 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  62.9 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  60.47 
 
 		 343 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  61.24 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  62.43 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  63.52 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  62.11 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  61 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  61 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  57.94 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  59.88 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  59.88 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  59.88 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  59.88 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  59.88 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  57.94 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  59.57 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  57.94 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  59.88 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  59.88 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  57.94 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  60.06 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  59.38 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  56.33 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  56.15 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  52.33 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  49.38 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  64.44 
 
 		 180 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  41.96 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  40.77 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  40.6 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  40.91 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  36.22 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  42.04 
 
 		 235 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  42.04 
 
 		 235 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  35.94 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  36.26 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  34.53 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  35.85 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  34.53 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  35.76 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  36.42 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  35.41 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  34.49 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0856  hypothetical protein  51.69 
 
 		 133 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.045604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0311  portal protein PBSX family, truncation  52.27 
 
 		 95 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3263  bacteriophage capsid portal protein  48.39 
 
 		 99 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  23.88 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  22.13 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  22.54 
 
 		 420 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  33.67 
 
 		 121 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  23.64 
 
 		 524 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.41 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  21.14 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  21.14 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  20 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>