54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0896 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 341 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  69.91 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  63.98 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  63.17 
 
 		 353 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  47.68 
 
 		 348 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  45.65 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  45.48 
 
 		 335 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  49.04 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  47.27 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  37.64 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  37.46 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  35.24 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  36.31 
 
 		 344 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  45.58 
 
 		 235 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  45.58 
 
 		 235 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  38.31 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  35.08 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  35.2 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  33.02 
 
 		 363 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  33.33 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  34.58 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  34.24 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  36.17 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  34.24 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  33.02 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  34.24 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  33.02 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  32.7 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  32.7 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  32.7 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  32.7 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  35.28 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  35.35 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  33.64 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  35.6 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  35.62 
 
 		 342 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  35.76 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  35.29 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  33.85 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  34.88 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  32.01 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  33.85 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  33.11 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  33.97 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  34.44 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  34.81 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  32.78 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  34.56 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  32.78 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  30.28 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0944  putative portal vertex protein  66.98 
 
 		 121 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.592836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  40.51 
 
 		 180 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  26.61 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  27.12 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>