55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2917 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 348 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  54.99 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  57.59 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  57.94 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  55.88 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  55.06 
 
 		 350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  55.39 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  55.39 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  53.06 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  55.69 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  53.7 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  52.77 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  56.92 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  53.06 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  50.88 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  52.33 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  53.17 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  53.17 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  51.18 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  51.18 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  51.34 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  51.98 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  51.18 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  52.5 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  50.88 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  50.75 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  50.75 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  50.75 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  50.75 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  50.89 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  51.51 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  50.59 
 
 		 337 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  51.58 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  46.37 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  37.65 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  37.35 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  40.98 
 
 		 338 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  38.44 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  56.11 
 
 		 180 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  36.11 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  35.86 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  32.19 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  31.87 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  40.44 
 
 		 235 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  40.44 
 
 		 235 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  31.46 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  36.26 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  34.62 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  30.12 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  33.8 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  31.96 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3263  bacteriophage capsid portal protein  47.37 
 
 		 99 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0856  hypothetical protein  37.93 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.045604  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  25.67 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0311  portal protein PBSX family, truncation  38.37 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>