44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3263 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 351 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 351 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  100 
 
 		 351 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  98.99 
 
 		 351 aa  201  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3263  bacteriophage capsid portal protein  100 
 
 		 99 aa  199  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  98.68 
 
 		 363 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  98.68 
 
 		 363 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  98.68 
 
 		 363 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  98.68 
 
 		 363 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  98.68 
 
 		 337 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  98.68 
 
 		 363 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  98.68 
 
 		 337 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  97.37 
 
 		 337 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  55.56 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  55.56 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  60.71 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  55 
 
 		 345 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  60.24 
 
 		 338 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  56.25 
 
 		 343 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  48.6 
 
 		 361 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  51.52 
 
 		 339 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  50.54 
 
 		 343 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  56.94 
 
 		 341 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  47.42 
 
 		 350 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  49.46 
 
 		 342 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  56.94 
 
 		 341 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  56.94 
 
 		 342 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  48.39 
 
 		 343 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  58.57 
 
 		 346 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  49.4 
 
 		 350 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0856  hypothetical protein  93.48 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.045604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  53.42 
 
 		 341 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0311  portal protein PBSX family, truncation  93.48 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  46.32 
 
 		 348 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  47.47 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  39.81 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  44.93 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  45.71 
 
 		 338 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  34.65 
 
 		 347 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  33.66 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  40.3 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  35.62 
 
 		 344 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  39.39 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  36.36 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>