67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3834 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  100 
 
 		 350 aa  732    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  59.31 
 
 		 355 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  51.95 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  52.78 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  52.7 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  49.54 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  47.84 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  53.5 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  51.26 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  51.38 
 
 		 341 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  51.23 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  48.82 
 
 		 338 aa  348  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  51.08 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  49.38 
 
 		 343 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  51.72 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  48.05 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  47.58 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  46.31 
 
 		 351 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  46.31 
 
 		 351 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  46.31 
 
 		 351 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  45.45 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  45.45 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  45.45 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  48.42 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  45.45 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  45.45 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  48.73 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  48.1 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  45.95 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  47.85 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  46.13 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  46.82 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  49.21 
 
 		 341 aa  325  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  46.37 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  39.29 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  38.99 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  38.32 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  36.91 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  47.75 
 
 		 180 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  33.44 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  39.64 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  39.64 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  32.78 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  30.95 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  32.45 
 
 		 353 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  32.45 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  32.36 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  30.86 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  32.47 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  31.41 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  28.19 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0856  hypothetical protein  41.35 
 
 		 133 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.045604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0311  portal protein PBSX family, truncation  44.44 
 
 		 95 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3263  bacteriophage capsid portal protein  44.93 
 
 		 99 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  23.61 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0645  phage portal protein, PBSX family  28.26 
 
 		 615 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0834  phage portal protein, PBSX family  28.26 
 
 		 612 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  24.73 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  23.76 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  25.93 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  25.93 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  22.86 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  24.86 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  24.69 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  21.72 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  23.2 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  23.75 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>