121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0586 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  100 
 
 
397 aa  803    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
397 aa  803    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  61.67 
 
 
391 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  64 
 
 
400 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  58.71 
 
 
391 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  60.45 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  56.06 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  58.89 
 
 
391 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  59.55 
 
 
391 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  57.99 
 
 
393 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  57.07 
 
 
391 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  58.68 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  59.44 
 
 
386 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  57.63 
 
 
390 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  55.59 
 
 
384 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  57.26 
 
 
397 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  51.12 
 
 
401 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  48.48 
 
 
400 aa  356  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  51.86 
 
 
386 aa  355  6.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  51.93 
 
 
396 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  49.35 
 
 
391 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  50.79 
 
 
390 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  44.17 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  45.48 
 
 
397 aa  327  3e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  43.85 
 
 
393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  50.84 
 
 
388 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  41.49 
 
 
396 aa  298  1e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  51.59 
 
 
389 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  44.75 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  48.69 
 
 
368 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  47.49 
 
 
351 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  31.79 
 
 
399 aa  123  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  27.95 
 
 
413 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  27.95 
 
 
413 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  28.03 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  27.61 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  26.21 
 
 
440 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  25.89 
 
 
416 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  27.12 
 
 
444 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.73 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.48 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  29.09 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  25.65 
 
 
1102 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.59 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  28.36 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  28.15 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  28.36 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  26.65 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  28.2 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  26.45 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  24.91 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  25.92 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.84 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  23.49 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  23.2 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  24.19 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.17 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  24.19 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  22.01 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  24.48 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.35 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  28.52 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.44 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.35 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  24.83 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.05 
 
 
447 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.62 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.03 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  27.03 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.52 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  28.94 
 
 
457 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.34 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  26.34 
 
 
445 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  25.75 
 
 
372 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  23.55 
 
 
429 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.47 
 
 
455 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  21.89 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  21.89 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  26.62 
 
 
445 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  24.1 
 
 
859 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  27.21 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  21.61 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  26.11 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  27.1 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.1 
 
 
833 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.1 
 
 
833 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  23.88 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  26.6 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  27.02 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  24.32 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  24.03 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  27.6 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  27.6 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>