150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1286 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
384 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  55.05 
 
 
412 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  39.51 
 
 
444 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  37.53 
 
 
440 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  38.52 
 
 
420 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  37.15 
 
 
414 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  36.87 
 
 
414 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  36.52 
 
 
421 aa  255  7e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  41.1 
 
 
416 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  39.66 
 
 
434 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  40.57 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  37.97 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  36.36 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  38.99 
 
 
407 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  32.89 
 
 
425 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  32.89 
 
 
425 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  32.89 
 
 
425 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  36.54 
 
 
404 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  34.05 
 
 
423 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  36.44 
 
 
444 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  35.83 
 
 
431 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  30.62 
 
 
390 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  33.43 
 
 
407 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  32.8 
 
 
413 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  36.73 
 
 
409 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  32.8 
 
 
413 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  33.51 
 
 
413 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.94 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  31.32 
 
 
426 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  35.71 
 
 
408 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  30.95 
 
 
417 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  35.9 
 
 
434 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  33.51 
 
 
432 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  30.95 
 
 
389 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  36.83 
 
 
397 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  32.8 
 
 
434 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  34.47 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  32.57 
 
 
416 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  30.32 
 
 
408 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  33.43 
 
 
414 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  30.39 
 
 
417 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  31.45 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  35.49 
 
 
429 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  33.14 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 
411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  30.81 
 
 
416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  30.81 
 
 
416 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  26.09 
 
 
436 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  28.2 
 
 
398 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  31.64 
 
 
445 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  31.64 
 
 
445 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.2 
 
 
395 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.25 
 
 
460 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  26.12 
 
 
409 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  29.97 
 
 
428 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  32.85 
 
 
429 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  29.67 
 
 
420 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  31.7 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.08 
 
 
473 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.44 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  38.69 
 
 
225 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.92 
 
 
544 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  30.12 
 
 
542 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  25.41 
 
 
428 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  29.44 
 
 
833 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  29.44 
 
 
833 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  29.44 
 
 
859 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  28.29 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  29.43 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  26.81 
 
 
408 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.43 
 
 
447 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  27.16 
 
 
411 aa  126  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  27.78 
 
 
393 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  28.92 
 
 
407 aa  123  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  29.22 
 
 
406 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  26.51 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27.3 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  27.06 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  32.01 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  24.04 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.82 
 
 
392 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  26.43 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  30.87 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  31.23 
 
 
391 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.05 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.14 
 
 
399 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  26.32 
 
 
389 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  26.32 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  25.65 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.57 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  31.52 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  29.3 
 
 
408 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 
433 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  29.6 
 
 
393 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  29.97 
 
 
391 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  29.04 
 
 
400 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  25.95 
 
 
399 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.33 
 
 
455 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>