129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1410 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  91.56 
 
 		 391 aa  741    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  78.04 
 
 		 391 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  79.74 
 
 		 391 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  78.97 
 
 		 391 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  100 
 
 		 391 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  75.19 
 
 		 391 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  60.47 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  60.05 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  61.17 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  60.37 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  63.07 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  56.06 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  56.06 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  60.96 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  55.68 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  54.62 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  52.53 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  52.89 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  52.83 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  52.83 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  51.74 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  51.59 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  52.01 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  44.56 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  45.11 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  44.02 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  42.74 
 
 		 396 aa  311  9e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  49.28 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  50.62 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  48.58 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  40.87 
 
 		 477 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  30.86 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  31.52 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  27.73 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  30.41 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  29.17 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  29.17 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  27.96 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  28.45 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  31.8 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  35.14 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  31.45 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  31.45 
 
 		 413 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  29.21 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  26.3 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  28.33 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  26.51 
 
 		 434 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  28.81 
 
 		 1102 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.5 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.17 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  27.05 
 
 		 524 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  27.27 
 
 		 434 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.65 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  25.61 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25.93 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  25.61 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.84 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  26.72 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3484  portal protein  23.85 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  26.45 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  26.72 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.9 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  24.47 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.55 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  22.51 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  26.28 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  24.5 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.28 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  26.45 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  22.94 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  24.57 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  28.16 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  27.58 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.85 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.38 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  26.73 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.03 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  26.73 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  28.07 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  22.69 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.72 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.81 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  24.64 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  26.98 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  26.82 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  27.11 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  26.98 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  27.12 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.72 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  23.89 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  23.89 
 
 		 859 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  23.89 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  27.52 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  25.07 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  28.34 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>