116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2002 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  100 
 
 		 368 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  64.31 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  50.43 
 
 		 384 aa  311  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  50.29 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  49.57 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  49.3 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  50.42 
 
 		 391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  48.58 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  49.15 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  50.42 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  47.4 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  48.69 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  48.69 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  51.31 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  50.57 
 
 		 390 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  46.06 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  51.18 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  44.42 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  46.59 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  47.14 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  47.38 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  49.3 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  47.09 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  45.8 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  36.73 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  46.36 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  36.22 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  37.91 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  37.96 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  46.24 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  37.78 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  28.26 
 
 		 444 aa  109  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  31.39 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  27.04 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  26.04 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.67 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  29.58 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  27.4 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  28.62 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  28.28 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  33.17 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  31.02 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  29.46 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  29.92 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  26.69 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  26.16 
 
 		 524 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.68 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  26.69 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  26.62 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  29.44 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.88 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  23.13 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  22.64 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  23.13 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  23.13 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  27.97 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  31.34 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  27.16 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  28.14 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  27.59 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  26.01 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  27.57 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.12 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  26.39 
 
 		 1102 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.76 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  29.41 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.25 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.27 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  29.41 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3484  portal protein  23.89 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  23.05 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  23.57 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.87 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.4 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.4 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.49 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  24.44 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  22.51 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  28.23 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.51 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  28.02 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.56 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  28.36 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  23.96 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  27.59 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  26.18 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.56 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  21.91 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  23.88 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.45 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  21.28 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  22.22 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  24.63 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  27.4 
 
 		 473 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  23.08 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  23.9 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  22.81 
 
 		 454 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>