136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4284 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 		 454 aa  934    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 		 454 aa  934    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  64.41 
 
 		 455 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  61.11 
 
 		 455 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  60.33 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  59.4 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  52.78 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  54.55 
 
 		 859 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  54.55 
 
 		 833 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  54.55 
 
 		 833 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  51.36 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  27.7 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  27.76 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.87 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  28.43 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  28.43 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  26.26 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.48 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  26.8 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  26.8 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  26.8 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  23.1 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  27.61 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  26.91 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  25.07 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  29.91 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  23.53 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  25.85 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  28.33 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  27.04 
 
 		 416 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.35 
 
 		 421 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  27.91 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 416 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  25.55 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24.15 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  25.91 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.14 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.88 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  25.95 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.37 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  28.78 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  27.65 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  29.25 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  25.62 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  27.2 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  25.41 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  25.24 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  25.15 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.41 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  25.33 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  25.63 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  23.68 
 
 		 393 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  23.89 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  25.73 
 
 		 397 aa  93.2  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.46 
 
 		 544 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  22.25 
 
 		 445 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.19 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  24.79 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  26.36 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  25.34 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.06 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.79 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  22.74 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  24.42 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  25.8 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  23.61 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  28.21 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  25.42 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  29.03 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  24.79 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  23.67 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  24.59 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  26.17 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  26.01 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  25.84 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  22.51 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  25.76 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  26.98 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  26.72 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  25.33 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  23.46 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  25.45 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  23.33 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  23.45 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  26.98 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  24.83 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  24.43 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  26.86 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  27.15 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  22.1 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  26.06 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  24.47 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>