124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1433 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  96.67 
 
 		 390 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 390 aa  773    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  91.95 
 
 		 386 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  69.89 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  63.4 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  60.53 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  61.17 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  61.17 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  61.15 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  62.37 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  60.1 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  59.64 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  58.68 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  58.68 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  57.96 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  55 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  54.03 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  55.61 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  56.55 
 
 		 400 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  55.35 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  53.33 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  52.66 
 
 		 386 aa  362  8e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  55.8 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  44.76 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  43.24 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  43.44 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  54.11 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  50.15 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  40.66 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  51.18 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  44.65 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  34.42 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  29.3 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  29.92 
 
 		 1102 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  28.31 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  27.79 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  27.43 
 
 		 412 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  28.18 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  28.09 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  28.96 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  27.7 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.14 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  26 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.41 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  28.31 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  30.08 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  27.27 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  26.67 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  26.67 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  28.52 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.53 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  26.67 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  23.88 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  32.58 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  28.08 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  24.04 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  26.7 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  24.04 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  23.77 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.9 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  25.18 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  23.21 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  27.71 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  27 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  23.93 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  27.62 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.07 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  27.11 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  26.07 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  22.61 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  23.3 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  28.36 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  24.24 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  24.09 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  22.76 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  26.69 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  22.97 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.56 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.46 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  23.04 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  26.2 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  22.95 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  25.89 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  23.74 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  23.37 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  23.37 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  25.42 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  23.37 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.68 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.27 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25.58 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.73 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.73 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  25.63 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  23.08 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  21.07 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  25.97 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  24.63 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>