127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2688 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 		 464 aa  956    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  26.81 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  26.59 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  26.93 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  26.13 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  28.02 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  28.06 
 
 		 414 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  28.06 
 
 		 414 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.1 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  27.06 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.13 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  24.93 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  26.18 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  24.53 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  27.9 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  24.77 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  26.56 
 
 		 407 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  23.77 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  25.19 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  21.99 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  25.82 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  21.56 
 
 		 436 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  26.18 
 
 		 542 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  26.33 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  25.8 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  24.68 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  21.49 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  25.31 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  23.25 
 
 		 425 aa  90.1  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  23.25 
 
 		 425 aa  90.1  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  23.25 
 
 		 425 aa  90.1  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  26.38 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  24.7 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  24.29 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  24.81 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  23.08 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  21.37 
 
 		 544 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  23.75 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  26.14 
 
 		 416 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  23.11 
 
 		 426 aa  86.7  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  28.64 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  25.52 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  21.33 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  22.67 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  22.41 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  25.46 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  24.38 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  22.75 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  24.69 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  27.23 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  23.48 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  25.85 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  23.46 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  23.55 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  23.39 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  24.69 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  24.94 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  22.28 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  23.76 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.88 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  23.2 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  25.4 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  22.81 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  22.81 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  21.63 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  24.44 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  21.28 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  23.1 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  19.73 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.12 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  22.74 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  19.1 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  24.51 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  22.62 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  20.88 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.22 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.22 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  21.27 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  22.46 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  22.84 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  18.38 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  23.22 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  25.37 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  20.42 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  22.98 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.96 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  23.02 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  23.53 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  24.63 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  20.81 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  25.1 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  18.97 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  18.97 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  23.7 
 
 		 455 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  29.51 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  24.52 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  22.16 
 
 		 859 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  29.51 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>