133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1628 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  96.43 
 
 		 399 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  100 
 
 		 392 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  50.62 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  46.47 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  44.5 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  35.71 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  35.16 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  33.78 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  33.07 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  30.79 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  31.41 
 
 		 416 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  30.26 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  29.74 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  30.9 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  31.18 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  29.74 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  32.11 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.75 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  30.23 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  28.15 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  28.42 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  29.45 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  27.97 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.09 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  25.82 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.4 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  25.62 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  28.61 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.61 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.61 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.61 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.97 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  26.89 
 
 		 424 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  24.12 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.13 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.9 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  25.14 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  24.52 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  28.63 
 
 		 833 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  28.63 
 
 		 859 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  28.63 
 
 		 833 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.2 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  26.02 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  25.75 
 
 		 413 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  26.7 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.79 
 
 		 454 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.79 
 
 		 454 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  28.79 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  25.32 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  28.79 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  25.32 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  25.96 
 
 		 460 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.29 
 
 		 544 aa  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.89 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  26.61 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.06 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  28.79 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.77 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.77 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.73 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  24.78 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.51 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  23.78 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  25.22 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.58 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.81 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  25.88 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  26.95 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  27.66 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  23.3 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  23.56 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  24.79 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  23.78 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  24.32 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  22.95 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  26.86 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  27.95 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  24.58 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  24.03 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  23.71 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  26.65 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  24.03 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  24.36 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  28.28 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  28.5 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.3 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  25.35 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  25.35 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  34.06 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  23.33 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  27.78 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  29.33 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  25.55 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  27.71 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  22.06 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  23.92 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>