118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3119 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  100 
 
 		 389 aa  770    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  64.31 
 
 		 368 aa  401  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  50.14 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  49.15 
 
 		 391 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  49.46 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  51.42 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  51.29 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  51.29 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  49.28 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  45.78 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  48.86 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  48.12 
 
 		 386 aa  312  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  51.59 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  51.59 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  51.02 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  47.28 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  49.71 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  50.15 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  47.09 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  47.46 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  44.03 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  50.28 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  46.96 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  46.67 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  43.37 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  37.5 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  35.8 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  38.38 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  38.31 
 
 		 396 aa  245  6.999999999999999e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  46.62 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  40.12 
 
 		 477 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  30.66 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  30.16 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  28.19 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  26.58 
 
 		 444 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  25.72 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  26.33 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  26.33 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  28.51 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  27.87 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.79 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  27.43 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  26.99 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  22.67 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  28.72 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.84 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  32.05 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  29.53 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  26.73 
 
 		 1102 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.65 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  24.34 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.41 
 
 		 544 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  27.56 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  27.96 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  24.04 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  27.15 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  24.04 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  22.62 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27.65 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  26.15 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.37 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  27.15 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  26.07 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  24.07 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.34 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.09 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.41 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.27 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  25.37 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  23.18 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  20.95 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  20.95 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.11 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  28.95 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.29 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  28.28 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  28.28 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  23.2 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  22.62 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  22.97 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  22.74 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  20.61 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  23.4 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  32.99 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  32.99 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  21.2 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  23.68 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  30.64 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3484  portal protein  22.74 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  27.78 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  24.29 
 
 		 473 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.11 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  27.87 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.46 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  23.2 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  23.5 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.1 
 
 		 833 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.1 
 
 		 859 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>