82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0650 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0650  phage portal protein  100 
 
 		 353 aa  716    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3170  phage portal protein, PBSX family  25.17 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1355  PBSX family phage portal protein  24.76 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.694931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1400  Phage portal protein, PBSX  24.58 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3288  PBSX family phage portal protein  27.27 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4834  PBSX family phage portal protein  25.08 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2778  PBSX family phage portal protein  23.61 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0923  PBSX family phage portal protein  23.83 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0145  PBSX family phage portal protein  26.07 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3051  phage portal protein, pbsx family  23.88 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1941  bacteriophage protein  24.25 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1812  PBSX family phage portal protein  26.07 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2691  PBSX family phage portal protein  26.07 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2741  PBSX family phage portal protein  26.07 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2315  PBSX family phage portal protein  24.75 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0135  PBSX family phage portal protein  26.57 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2261  portal protein PBSX family  24.75 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2823  portal protein PBSX family  24.75 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2336  PBSX family phage portal protein  24.75 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00832  probable capsid portal protein  23.49 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0128  portal protein PBSX family  24.75 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0335  Phage portal protein  24.75 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0208  PBSX family phage portal protein  25.25 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.444243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1353  PBSX family phage portal protein  24.75 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00953251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2869  phage portal protein, pbsx family  23.2 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37620  Phage portal protein  25.54 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3053  phage portal protein, pbsx family  25.08 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355995  hitchhiker  0.00000000672822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2917  PBSX family phage portal protein  25.67 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  22.67 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4322  PBSX family phage portal protein  25.08 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2325  PBSX family phage portal protein  24.34 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.916236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2640  phage portal protein, PBSX family  21.71 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4257  portal protein  28.63 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3834  phage portal protein, PBSX family  23.61 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0834  phage portal protein, PBSX family  28.44 
 
 		 612 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01364  phage portal protein, pbsx family  30.14 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.364457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0694  PBSX family phage portal protein  23.76 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2768  PBSX family phage portal protein  24.65 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647228  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1473  PBSX family phage portal protein  24.65 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1059  PBSX family phage portal protein  24.91 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4363  phage portal protein pbsx family  23.55 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000346537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3502  PBSX family phage portal protein  21.84 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0990  PBSX family phage portal protein  28.3 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0588  PBSX family phage portal protein  23.44 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432938  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0645  phage portal protein, PBSX family  28.12 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  28.99 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  26.11 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  26.11 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0896  PBSX family phage portal protein  26.61 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.647751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1025  phage portal protein  24.71 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  22.64 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  25.56 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0238  phage portal protein, PBSX family  25.17 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00721775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  22.3 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  31.11 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  26.06 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3494  phage portal protein, pbsx family  26.05 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  4.19269e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2938  phage portal protein pbsx family  26.05 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  3.19492e-28 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.24 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2801  phage portal protein, pbsx family  25.63 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  22.76 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5051  PBSX family phage portal protein  25.75 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0705  PBSX family phage portal protein  25.75 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  22.33 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.77 
 
 		 411 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  27.01 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  27.94 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  26.43 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  28.44 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  25.55 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  25.55 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  23.21 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0719  PBSX family phage portal protein  23.9 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  26.06 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  24.64 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1281  PBSX family phage portal protein  30.28 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.828599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05024  hypothetical protein  24.69 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  23.72 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  23.83 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  27.54 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  22.83 
 
 		 477 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>