144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0647 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  100 
 
 		 434 aa  890    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  52.15 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  47.73 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  44.73 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  44.69 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  42.52 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  39.61 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  39.67 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  39.67 
 
 		 416 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  39.51 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  38.92 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  39.02 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  39.02 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  37.23 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  36.7 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  34.56 
 
 		 445 aa  230  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  35.52 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  33.7 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.43 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  34.03 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  34.03 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  33.42 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  33.42 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  33.42 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  35.9 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  36.07 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  30.97 
 
 		 421 aa  199  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  32.1 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  35.47 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  31.16 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  33.61 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  31.16 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  31.16 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  29.56 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  33.05 
 
 		 409 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  31.16 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  32.05 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  31.39 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  30.79 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  30.64 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  32.14 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  29.72 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  29.9 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  29.48 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  28.73 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  28.89 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  29.75 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  30.25 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.73 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  26.88 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.72 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.94 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  30 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  29.01 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  30.97 
 
 		 542 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  28.53 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  28.68 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  23.9 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.56 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.96 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.84 
 
 		 544 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  27.42 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  25.81 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  26.82 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  32.35 
 
 		 225 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.06 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  26.33 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.53 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  26.49 
 
 		 859 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  27.23 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  27.23 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  26.49 
 
 		 833 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  26.49 
 
 		 833 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.03 
 
 		 406 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  23.85 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  23.85 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.55 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  26.54 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  27.3 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  27.56 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  22.34 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  24.8 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  26.89 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  23.58 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  28.69 
 
 		 264 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  21.9 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3716  portal protein  25.21 
 
 		 404 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3767  portal protein  25.21 
 
 		 404 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  23.58 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  26.72 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.86 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  25.27 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  25.5 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.18 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  25.79 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  25.36 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  23.28 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  26.6 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>