151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2265 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
413 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  99.03 
 
 
413 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  98.79 
 
 
413 aa  857    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2495  phage portal protein, HK97 family  97.14 
 
 
157 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0490776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  40.16 
 
 
419 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  37.7 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  40.1 
 
 
420 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  39.42 
 
 
409 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  38.74 
 
 
414 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  38.48 
 
 
414 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  38.14 
 
 
440 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  36.3 
 
 
408 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  36.07 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  36.8 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  37.06 
 
 
421 aa  241  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  33.59 
 
 
524 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  33.68 
 
 
417 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  34.54 
 
 
431 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  34.54 
 
 
444 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  33.94 
 
 
417 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  33.43 
 
 
390 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  36.68 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  34.92 
 
 
407 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  34.25 
 
 
434 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  31.89 
 
 
426 aa  210  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  32.79 
 
 
423 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  33.25 
 
 
434 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  32.8 
 
 
384 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  31.92 
 
 
416 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  31.92 
 
 
416 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  30.73 
 
 
429 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.38 
 
 
407 aa  200  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.78 
 
 
404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  32.68 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  31.96 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  31.96 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  31.96 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  30.85 
 
 
432 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  31.86 
 
 
436 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  32.79 
 
 
420 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  31.17 
 
 
428 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  30.19 
 
 
409 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.69 
 
 
460 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  31.78 
 
 
445 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  31.03 
 
 
434 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  32.69 
 
 
429 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  32.84 
 
 
473 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  29.81 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  30.02 
 
 
415 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  31.25 
 
 
434 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 
411 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  30.1 
 
 
412 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  31.71 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  31.05 
 
 
408 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  27.47 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  32.77 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  31 
 
 
404 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  29.83 
 
 
393 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  31.73 
 
 
542 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  30.14 
 
 
398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.87 
 
 
428 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  29.13 
 
 
416 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  28.84 
 
 
445 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  27.91 
 
 
392 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  27.25 
 
 
445 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  28.97 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  27.94 
 
 
413 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  30.15 
 
 
397 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.59 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.08 
 
 
544 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  26.55 
 
 
413 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.86 
 
 
395 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.72 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  28.39 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  27.14 
 
 
417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.4 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.63 
 
 
436 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.63 
 
 
436 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.4 
 
 
406 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.36 
 
 
433 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  26.03 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  26.14 
 
 
407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.65 
 
 
455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  36.64 
 
 
225 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.42 
 
 
457 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.87 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  24.13 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  25.91 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  28.17 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  31.1 
 
 
391 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  23.84 
 
 
833 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  23.84 
 
 
833 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  23.84 
 
 
859 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  24.37 
 
 
397 aa  104  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  23.93 
 
 
404 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  23.93 
 
 
389 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  31.8 
 
 
391 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  32.51 
 
 
391 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 
454 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>