90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3705 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3705  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 477 aa  964    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  49.58 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  41.65 
 
 		 397 aa  306  7e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  38.77 
 
 		 393 aa  282  8.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  38.93 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  44.51 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  43.15 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  44.75 
 
 		 397 aa  273  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0007  HK97 family phage portal protein  39.04 
 
 		 396 aa  273  7e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000540327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  44.75 
 
 		 397 aa  273  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  44.2 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  42.71 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  42.49 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  41.52 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  41.04 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  40.87 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1433  HK97 family phage portal protein  44.65 
 
 		 390 aa  256  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.273066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  39.74 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1707  phage portal protein, HK97 family  43.6 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.0531802 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  42.44 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  41.37 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  42.7 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  44.32 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  42.42 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  39.88 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1075  HK97 family phage portal protein  41.57 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.529897  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  39.45 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  42.39 
 
 		 397 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  40.18 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  40.12 
 
 		 389 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2002  Phage portal protein, HK97  37.78 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.443505  hitchhiker  0.004041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  27.32 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  24 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  23.71 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  23.92 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  27.84 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  22.38 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  26.55 
 
 		 1102 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  25.28 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  22.9 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  25.2 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.61 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3484  portal protein  22.94 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.52 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  26.58 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3880  portal protein  24.28 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100107  normal  0.024166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  24.75 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  24.83 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.79 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.71 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  23.81 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  22.51 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  21.9 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  21.9 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  21.9 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  22.22 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  23.55 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  23.43 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.81 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  24.91 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.48 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  22.78 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  21.52 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  24.84 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  21.52 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  24 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  22.8 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  22.9 
 
 		 424 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  22.95 
 
 		 833 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  22.95 
 
 		 859 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  22.95 
 
 		 833 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  22.3 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  24.6 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  23.29 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  23.26 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  23.55 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  23.51 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  22.9 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.11 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.11 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.33 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  23.97 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  24.84 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  21.05 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.45 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  21.4 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  25.6 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  23.57 
 
 		 416 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  23.73 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  22.96 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>